Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYTL4Q96C24 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYTL4Q96C24 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYTL4Q96C24 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SYTL4Q96C24 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms