Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM18Q96B42 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM18Q96B42 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM18Q96B42 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM18Q96B42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM18Q96B42 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM18Q96B42 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms