Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRF1Q92994 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRF1Q92994 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRF1Q92994 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRF1Q92994 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 537.7 ms