Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
PRG4Q92954 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PRG4Q92954 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRG4Q92954 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRG4Q92954 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms