Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL3LQ92901 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3LQ92901 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3LQ92901 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3LQ92901 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms