Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 NTG1YAL015C 1200 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 MIM2YLR099W-A 264 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 HIS7YBR248C 1659 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 YRA1YDR381W 681 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 PRP46YPL151C 1356 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 SUF5tG(CCC)O 72 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 SMK1YPR054W 1167 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 ITR1YDR497C 1755 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 YLR118CYLR118C 684 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 GYP8YFL027C 1494 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 EEB1YPL095C 1371 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1B-ORQ92393 YPL277CYPL277C 1464 nt8.84□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 YMR253CYMR253C 1245 nt8.83□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 TEP1YNL128W 1305 nt8.82□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 YER010CYER010C 705 nt8.81□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 SHE10YGL228W 1734 nt8.81□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 YLR173WYLR173W 1827 nt8.81□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 ECM27YJR106W 2178 nt8.81□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 GLN1YPR035W 1113 nt8.81□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 COS9YKL219W 1224 nt8.8□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 GLE1YDL207W 1617 nt8.8□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 TDH3YGR192C 999 nt8.79□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 BCY1YIL033C 1251 nt8.79□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 MRPL4YLR439W 960 nt8.79□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 PET112YBL080C 1626 nt8.79□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 MHR1YDR296W 681 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 YEA6YEL006W 1008 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 SUP19tS(UGA)E 82 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 SUP17tS(UGA)I 82 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 SUP16tS(UGA)P 82 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 COA1YIL157C 594 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 COX26YDR119W-A 201 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 SER1YOR184W 1188 nt8.78□□□□□ -1
TY1B-ORQ92393 YDR278CYDR278C 318 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 EFM1YHL039W 1758 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 PYC2YBR218C 3543 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 HSP12YFL014W 330 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 YJU3YKL094W 942 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 THI21YPL258C 1656 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 MMP1YLL061W 1752 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 NPA3YJR072C 1158 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 YRF1-2YER190W 5046 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 LAS21YJL062W 2493 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 YHR131CYHR131C 2553 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 HHY1YEL059W 309 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 FRS2YFL022C 1512 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 TFS1YLR178C 660 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 RCL1YOL010W 1104 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 RER2YBR002C 861 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 YML082WYML082W 1950 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 CRP1YHR146W 1398 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 POB3YML069W 1659 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 LAS17YOR181W 1902 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 COX5AYNL052W 462 nt8.71□□□□□ -1.01
TY1B-ORQ92393 PHO8YDR481C 1701 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 LPD1YFL018C 1500 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 FAA4YMR246W 2085 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 YBR016WYBR016W 387 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 SES1YDR023W 1389 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 CBC2YPL178W 627 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 RPT3YDR394W 1287 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 SSK22YCR073C 3996 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 BUD28YLR062C 378 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 CBF1YJR060W 1056 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 YML083CYML083C 1257 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 YUR1YJL139C 1287 nt8.65□□□□□ -1.02
TY1B-ORQ92393 GET3YDL100C 1065 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 GCS1YDL226C 1059 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 PIN2YOR104W 849 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 ARO2YGL148W 1131 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 RPS15YOL040C 429 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 ETR1YBR026C 1143 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 PGA3YML125C 939 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 MET8YBR213W 825 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 GUT1YHL032C 2130 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 JAC1YGL018C 555 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 GTB1YDR221W 2109 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 RPN12YFR052W 825 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 MGR2YPL098C 342 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 KIN1YDR122W 3195 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 YME1YPR024W 2244 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 DMA1YHR115C 1251 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 TDA6YPR157W 1404 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1B-ORQ92393 SRF1YDL133W 1314 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 COX18YGR062C 951 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 OST3YOR085W 1053 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 DPH2YKL191W 1605 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 LYS12YIL094C 1116 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 VPS1YKR001C 2115 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 TAL1YLR354C 1008 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 DIA3YDL024C 1407 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 PAD1YDR538W 729 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 FHN1YGR131W 525 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 GID7YCL039W 2238 nt8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.4 ms