Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l1Q920A7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Afg3l1Q920A7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Afg3l1Q920A7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Afg3l1Q920A7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms