Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca5Q91ZW3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca5Q91ZW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarca5Q91ZW3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarca5Q91ZW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms