Protein–RNA interactions for Protein: Q91WR6

Ginm1, Glycoprotein integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ginm1Q91WR6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ginm1Q91WR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ginm1Q91WR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ginm1Q91WR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ginm1Q91WR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ginm1Q91WR6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms