Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usb1Q91W78 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usb1Q91W78 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usb1Q91W78 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usb1Q91W78 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms