Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOCS4Q8WXH5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOCS4Q8WXH5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SOCS4Q8WXH5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOCS4Q8WXH5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms