Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Washc1Q8VDD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Washc1Q8VDD8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Washc1Q8VDD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc1Q8VDD8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc1Q8VDD8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc1Q8VDD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc1Q8VDD8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Washc1Q8VDD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms