Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk8Q8R3L8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk8Q8R3L8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk8Q8R3L8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms