Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc12Q8R344 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc12Q8R344 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc12Q8R344 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms