Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PATJQ8NI35 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATJQ8NI35 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATJQ8NI35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms