Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN4YQ8NFZ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4YQ8NFZ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 897.5 ms