Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC44A5Q8NCS7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC44A5Q8NCS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC44A5Q8NCS7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms