Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A9Q8NBW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC38A9Q8NBW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms