Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPC24Q8NBT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms