Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms