Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FSIP1Q8NA03 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSIP1Q8NA03 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FSIP1Q8NA03 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms