Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf163Q8N9P6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf163Q8N9P6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms