Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD7Q8N8D1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD7Q8N8D1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDCD7Q8N8D1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD7Q8N8D1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms