Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC82Q8N4S0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms