Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CMTR1Q8N1G2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CMTR1Q8N1G2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CMTR1Q8N1G2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms