Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfip2Q8K221 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfip2Q8K221 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfip2Q8K221 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms