Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pnpt1Q8K1R3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnpt1Q8K1R3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpt1Q8K1R3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpt1Q8K1R3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms