Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPUSD2Q8IZ73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPUSD2Q8IZ73 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPUSD2Q8IZ73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms