Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC116Q8IYX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC116Q8IYX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC116Q8IYX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms