Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms