Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA4Q8IV77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNGA4Q8IV77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms