Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR49Q8IV35 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms