Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNJLQ8IV13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNJLQ8IV13 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNJLQ8IV13 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNJLQ8IV13 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNJLQ8IV13 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNJLQ8IV13 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNJLQ8IV13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms