Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syne4Q8CII8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syne4Q8CII8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms