Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI43

Myl6b, Myosin light chain 6B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl6bQ8CI43 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl6bQ8CI43 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myl6bQ8CI43 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myl6bQ8CI43 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms