Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phc3Q8CHP6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phc3Q8CHP6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phc3Q8CHP6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc3Q8CHP6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms