Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbm28Q8CGC6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm28Q8CGC6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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