Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8CDN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CDN1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CDN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CDN1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CDN1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CDN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CDN1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8CDN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms