Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spef2Q8C9J3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Spef2Q8C9J3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Spef2Q8C9J3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spef2Q8C9J3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Spef2Q8C9J3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms