Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933409G03RikQ8C5U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933409G03RikQ8C5U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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4933409G03RikQ8C5U0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
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4933409G03RikQ8C5U0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4933409G03RikQ8C5U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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