Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgif2Q8C0Y1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgif2Q8C0Y1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgif2Q8C0Y1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms