Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3aQ8BX90 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3aQ8BX90 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms