Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmod1Q8BVA4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod1Q8BVA4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms