Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ssc5dQ8BV57 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ssc5dQ8BV57 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ssc5dQ8BV57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssc5dQ8BV57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssc5dQ8BV57 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssc5dQ8BV57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ssc5dQ8BV57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Ssc5dQ8BV57 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Ssc5dQ8BV57 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Ssc5dQ8BV57 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssc5dQ8BV57 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssc5dQ8BV57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Ssc5dQ8BV57 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Ssc5dQ8BV57 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Ssc5dQ8BV57 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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Ssc5dQ8BV57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Ssc5dQ8BV57 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ssc5dQ8BV57 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
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Ssc5dQ8BV57 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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Ssc5dQ8BV57 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssc5dQ8BV57 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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