Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SheQ8BSD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SheQ8BSD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SheQ8BSD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms