Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnrc6bQ8BKI2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnrc6bQ8BKI2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms