Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z37

Topors, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporsQ80Z37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporsQ80Z37 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ToporsQ80Z37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ToporsQ80Z37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ToporsQ80Z37 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms