Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5bQ80Y84 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5bQ80Y84 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5bQ80Y84 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5bQ80Y84 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5bQ80Y84 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5bQ80Y84 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5bQ80Y84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5bQ80Y84 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm5bQ80Y84 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms