Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc155Q80VJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc155Q80VJ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms