Protein–RNA interactions for Protein: Q80UN9

Trit1, tRNA dimethylallyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trit1Q80UN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trit1Q80UN9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trit1Q80UN9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trit1Q80UN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trit1Q80UN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms